ซีรี่ย์จีน ลิขิตรักไข่มุกมังกร (Legend of Dragon Pearl) เป็นละครย้อนยุคที่เนื้อหาถูกแต่งขึ้นเพื่อความบันเทิงโดยไม่ยึดโยงกับบุคคลหรือช่วงเวลาที่เฉพาะเจาะจง แต่มีการหยิบยกข้อเท็จจริงทางประวัติศาสตร์มาอ้างอิง เช่น กรณีที่ขุนนางยุคโชซอนยึดครองบ่อน้ำที่ไม่เคยแห้งเหือดในยามที่เกิดภัยแล้งเพื่อประโยชน์ส่วนตน และกรณีที่มีอำนาจมืดชักใยอยู่เบื้องหลังนโยบายต่างๆ ของพระราชา
เรื่องราวกล่าวถึงองค์ชายรัชทายาทแห่งราชวงศ์โชซอน นาม “ลีซอน” (ออกเสียงว่า “อีซอน”) ซึ่งถูกพระบิดาบังคับให้สวมหน้ากากปิดบังรูปโฉมตั้งแต่แบเบาะ หลังโตขึ้นแล้วไม่ได้รับความกระจ่างว่าทำไมตนต้องสวมหน้ากากตลอดเวลา และทำไมคนที่เห็นใบหน้าตนต้องตายสถานเดียว องค์ชายรัชทายาทจึงพยายามสืบหาคำตอบด้วยตัวเอง ครั้นพบว่าคนเดียวที่รู้คำตอบคือ “อูโบ” อดีตขุนนางฝ่ายบัณฑิตและอดีตอาจารย์แห่งสำนักศึกษาซองคยุนกวาน เขาจึงถอดหน้ากากแล้วแอบไปพบอูโบตามลำพัง นั่นจึงทำให้องค์ชายรัชทายาทได้พบและผูกมิตรกับลูกสาวขุนนางใหญ่ “ฮัน กาอึน” และชายหนุ่มฐานะต้อยต่ำที่มีชื่อว่า “อีซอน” เหมือนตน
หลังได้รู้เห็นความเป็นอยู่ของราษฎร องค์ชายรัชทายาทจึงคิดต่อกรกับองค์กรลับที่มีอำนาจล้นฟ้าอย่าง “พยอนซูฮเว” ด้วยเห็นว่าคนกลุ่มดังกล่าวไม่เพียงเข้าครอบงำราชสำนักและราชบัลลังก์ แต่ยังยึดครองแหล่งน้ำจนราษฎรขาดแคลนน้ำกินน้ำใช้โดยเฉพาะคนที่เป็นชนชั้นต่ำและยากจน แต่ทว่าการกระทำดังกล่าวกลับทำให้ผู้บริสุทธิ์ล้มตาย หนึ่งในนั้นคือขุนนางผู้จงรักภักดีอย่าง “ฮัน คยูโฮ” (บิดาของกาอึน) กาอึนจึงโกรธแค้นองค์ชายรัชทายาทเพราะเข้าใจผิดคิดว่าเขาเป็นคนลงมือฆ่าบิดาเธอ เพื่อช่วยเหลือราษฎรและต่อกรกับกลุ่มพยอนซูฮเว องค์ชายรัชทายาทและอีซอนจึงสลับฐานะกัน หลังจากนั้นอีซอนก็เข้ากลุ่มพยอนซูฮเวในฐานะองค์ชายรัชทายาท และถูกบังคับให้กินยาพิษ (เพื่อให้อยู่ภายใต้การควบคุม) ก่อนจับพลัดจับผลูได้เป็นพระราชาองค์ใหม่แทนพระราชาที่ถูกปลงพระชนม์ แม้ “แทมก” (ผู้นำกลุ่มพยอนซูฮเว) จะรู้ว่าอีซอนเป็นองค์ชายรัชทายาทตัวปลอม แต่เขาคิดว่ารัชทายาทตัวจริงถูกพวกตนสังหารแล้ว เลยจับอีซอนใส่หน้ากากแล้วแต่งตั้งเป็นพระราชาหุ่นเชิดหมายกุมอำนาจในโชซอนแบบเบ็ดเสร็จ ครั้นองค์ชายรัชทายาทรู้ซึ้งถึงความร้ายกาจของกลุ่มพยอนซูฮเว ประกอบกับได้เห็นความทุกข์ยากของราษฎร เขาจึงตัดสินใจว่าจะต่อสู้กับกลุ่มพยอนซูฮเว เพื่อปกป้องราษฎร แผ่นดิน และทวงบัลลังก์ของตนกลับคืนมา
ละครเปิดฉากด้วยการแนะนำความเป็นมาขององค์กรลับที่มีชื่อว่า “พยอนซูฮเว” ซึ่งเป็นองค์กรที่ก่อตั้งขึ้นมานานก่อนที่จะมีการสถาปนาราชวงศ์โชซอน แต่หลังจากองค์กรดังกล่าวมีส่วนร่วมในการสถาปนาพระราชาและมีบทบาทสำคัญในการวางรากฐานบ้านเมือง พวกเขาก็มีอำนาจล้นฟ้าและคอยชักใยอยู่เบื้องหลังพระราชา
เรื่องราวเริ่มต้นขึ้นภายในถ้ำลับของกลุ่มพยอนซูฮเว ซึ่งเป็นสถานที่ผลิตยาพิษที่เรียกว่า “ชิมกดฮวาน” ยาดังกล่าวทำจากดอกไม้มีพิษ (ดอกชิมกด) อาบด้วยพิษงู จึงมีพิษร้ายแรงยิ่งกว่ายาพิษใดๆ หากกินยาดังกล่าวเข้าไปแล้วจะต้องกินต่อเนื่องทุกๆ คืนเดือนเพ็ญ ถ้าขาดยาจะเจ็บปวดอย่างแสนสาหัสที่หัวใจและถึงแก่ความตายในที่สุด “แทมก” (ผู้นำกลุ่มพยอนซูฮเว) เตือนชายที่มาขอร่วมเป็นสมาชิกถึงพิษภัยของยาดังกล่าว จากนั้นก็ยื่นยาให้เขาพลางถามว่าเช่นนี้แล้วยังอยากเป็นส่วนหนึ่งของพยอนซูฮเวอยู่ไหม ชายคนดังกล่าวยืนยันความตั้งใจของตน เขาลั่นวาจาว่าหลังจบสิ้นฤดูการล่าจะไม่ฆ่าหมาล่าเนื้อ (จะไม่หักหลัง หรือเสร็จนาไม่ฆ่าโคถึกนั่นเอง) จากนั้นก็กินยาพิษเข้าไป ไม่นานยาก็เริ่มออกฤทธิ์ ครั้นถูกถามชื่อชายคนดังกล่าวจึงตอบว่าตนคือ “กึม-นยองแทกุน” (องค์ชายกึม-นยอง) นาม “ลียูน” (ชื่อ “ยูน” สกุลลี)
หลังกลุ่มพยอนซูฮเวรับเป็นสมาชิก องค์ชายกึม-นยองซึ่งอยู่ในสภาพคล้ายประสาทหลอนจึงสาบานว่าจะเก็บทุกสิ่งที่รู้เห็นเป็นความลับและจะทำตามกฏของพยอนซูฮเว (ขณะกล่าวคำสาบานเขาถูกของแหลมทิ่มบริเวณลำคอสามครั้ง หลังจากนั้นสติสัมปชัญญะของเขาก็เริ่มกลับคืนมา) แทมกให้มั่นว่านับจากนี้มีดที่เคยหันเข้าหาองค์ชายจะกลับกลายเป็นอาวุธที่คอยช่วยเหลือเขา กลุ่มพยอนซูฮเวจะเป็นทั้งโล่และอาวุธให้องค์ชายกึม-นยอง แต่ทว่าสักวันองค์ชายจะต้องจ่ายค่าตอบแทนให้พวกตน (ในเวลาเดียวกันนั้น เหล่านักฆ่าของพยอนซูฮเวได้บุกเข้าไปในวังหลวง เพื่อปลงพระชนม์พระราชาตามคำร้องขอขององค์ชายกึม-นยอง) องค์ชายกึม-นยองไม่เกี่ยงเรื่องค่าตอบแทน ขอเพียงให้ตนได้เป็นพระราชาแห่งโชซอน!!
